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環球視點!cDNA和基因組DNA的區別

2023-04-25 10:12:08來源:嗶哩嗶哩  

什么是cDNA

cDNA(互補DNA)是指其堿基序列與DNA互補的合成DNA。它是由RNA模板的逆轉錄產生的。總RNA,前mRNA,RNA,核糖體RNA或tRNA可用于逆轉錄。逆轉錄酶是催化從RNA產生cDNA的反應的酶。逆轉錄與PCR耦合如圖1所示。


(資料圖)

圖1.逆轉錄與PCR耦合

cDNA主要用于克隆原核基因組中的真核基因。外顯子由蛋白質的編碼區組成。在真核生物中,編碼區被內含子中斷。在轉錄過程中,內含子和外顯子都被編碼到前mRNA中。但是在mRNA加工過程中,內含子從mRNA中去除,通過將外顯子剪接在一起產生成熟的mRNA。生物體的總mRNA稱為轉錄組。然而,原核生物缺乏mRNA加工機制。因此,mRNA用于合成僅包含基因組蛋白質編碼區域的cDNA。這種cDNA用于將基因克隆成原核生物。cDNA在逆轉錄病毒中在RNA基因組轉化為DNA的過程中自然產生。

什么是基因組基因

基因組DNA(gDNA)是指基因組中染色體DNA的集合。特定生物體的全部基因集被稱為其基因組。然而,不僅基因組的基因是活躍的。大多數生物群在群體內具有相似類型的基因組DNA。生物體的基因組從下一代傳給另一代。通常,基因組由大量堿基對組成。例如,人類基因組由大約30億個堿基對組成。人類基因組的染色體如圖2所示。

圖2.人類基因組的染色體

在基因組DNA中發現的四種類型的序列是蛋白質編碼基因,串聯重復基因,重復DNA和間隔DNA。基因組DNA用于分子生物學的許多實驗。與cDNA的制備相比,基因組DNA的分離很容易。基因組 DNA 可用作 PCR 模板,用于克隆、測序、制備基因組文庫、DNA 指紋圖譜、研究基因結構和檢測突變/異常。

cDNA和基因組DNA的區別

定義

cDNA:cDNA是合成DNA,其堿基序列與基因組DNA互補。

基因組DNA:基因組DNA是基因組中染色體DNA的全套。

代表

cDNA:cDNA代表轉錄組。

基因組DNA:DNA代表基因組。

合成/提取自

cDNA:cDNA是由不同類型RNA的逆轉錄合成的。

基因組DNA:基因組DNA可以從現有基因組中提取。

內容

cDNA:cDNA由外顯子或編碼區組成。

基因組DNA:基因組DNA由生物體的編碼和非編碼序列組成。

數量

cDNA:cDNA包含一些堿基對。

基因組DNA:基因組DNA包含大量堿基對。

應用

cDNA:cDNA用于產生cDNA文庫。

基因組DNA:基因組DNA可用于產生基因組文庫。

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